Integral Proteins vs Proteine periferice
Proteinele sunt considerate molecule macro, care constau în una sau mai multe lanțuri de polipeptide. Lanțurile polipeptidice sunt alcătuite din aminoacizi legați împreună prin legături peptidice. Structura primară a unei proteine poate fi determinată prin secvența de aminoacizi. Anumite gene codifică multe proteine. Aceste gene determină secvența aminoacizilor, determinând astfel structura lor primară. Proteinele integrale și periferice sunt considerate "proteine de membrană plasmatică" din cauza apariției lor. Aceste proteine sunt, în general, responsabile de capacitatea celulei de a interacționa cu mediul extern.
Proteină integrată
Proteinele integrale se găsesc, în principal, fie complet sau parțial scufundate în bistratul fosfolipidelor membranei plasmatice. Aceste proteine au ambele regiuni polar și nepolar pe ele. Capurile polar ies din suprafața bistratificatorului, în timp ce regiunile nepolar sunt încorporate în acesta. De obicei, numai regiunile nepolare interacționează cu miezul hidrofob al membranei plasmei prin realizarea legăturilor hidrofobe cu cozile de acid gras ale fosfolipidelor.
Proteinele integrale care acoperă întreaga membrană de la suprafața interioară la suprafața exterioară se numesc proteine transmembranare. În proteinele transmembranare, ambele capete care ies din stratul lipidic sunt regiuni polar sau hidrofil. Regiunile de mijloc sunt nepolar și au aminoacizi hidrofobi pe suprafața lor. Trei tipuri de interacțiuni ajută la încorporarea acestor proteine în bilayerul lipidic, și anume interacțiunile ionice cu capetele polare ale moleculelor fosfolipide, interacțiunile hidrofobe cu cozile hidrofobe ale moleculelor fosfolipide și interacțiunile specifice cu anumite regiuni ale lipidelor, glicolipidelor sau oligozaharidelor.
Proteină periferică
Proteinele periferice (proteinele extrinseci) sunt prezente pe cea mai intactă și cea mai exterioară folie de fosfolipide. Aceste proteine se leagă în mod liber de membrana plasmatică fie direct prin interacțiuni cu capetele polare ale bistratului fosfolipidelor, fie indirect prin interacțiuni cu proteine integrale. Aceste proteine constituie aproximativ 20-30% din totalul proteinelor membranare.
Majoritatea proteinelor periferice se găsesc pe suprafața interioară sau pe suprafața citoplasmatică a membranei. Aceste proteine rămân limitate fie prin legături covalente cu catene grase, fie printr-o oligozaharidă la fosfolipide.
Care este diferența dintre proteine integrale și periferice?
• Proteinele periferice apar pe suprafața membranei plasmatice, în timp ce proteinele integrale apar fie complet sau parțial submersate în stratul lipidic al membranei plasmatice.
• Proteinele periferice se leagă în mod liber de bistratul lipidic și nu interacționează cu miezul hidrofob în două straturi de fosfolipide. Spre deosebire de aceasta, proteinele integrale sunt strâns legate și interacționează direct cu miezul hidrofob al membranei plasmatice. Din aceste motive, disocierea integrală a proteinelor este mai dificilă decât proteinele periferice.
• Tratamentele ușoare pot fi folosite pentru a izola proteinele periferice de membrana plasmatică, dar pentru izolarea proteinelor integrale, tratamentele ușoare nu sunt suficiente. Pentru a sparge legăturile hidrofobe, sunt necesare detergenți. Astfel, proteinele integrale pot fi izolate de membrana plasmatică.
• După izolarea acestor două proteine din membrana plasmatică, proteinele periferice pot fi dizolvate în tampoane apoase neutre, în timp ce proteinele integrale nu pot fi dizolvate în tampoane sau agregate apoase neutre.
• Spre deosebire de proteinele periferice, proteinele integrale sunt asociate cu lipide atunci când sunt solubilizate.
• Exemple de proteine periferice sunt spectrinul eritrocitelor, citocromului C și ATP-ului mitocondriilor și acetilcolinesterazei în membranele electroplaxice. Exemple de proteine integrale sunt enzimele legate de membrană, receptorii de medicamente și hormoni, antigenul și rodopsina.
• Proteinele integrale reprezintă aproximativ 70%, în timp ce proteinele periferice reprezintă porțiunea rămasă a proteinelor din membrana plasmatică.