Diferența dintre proteomica țintită și nedirijată

Diferența esențială dintre proteomica vizată și nedirecționată este aceea că proteomica vizate vizează măsurarea abundenței unei proteine ​​specifice, în timp ce proteomica nedirecționată nu vizează o proteină specifică.

Proteomica este studiul pe scară largă a proteinelor, structurilor și funcțiilor lor. Studiază întregul complement al proteinei într-o celulă, țesut sau într-un organism în condiții specifice. Există două tipuri de proteomică, cum ar fi proteomica vizată și proteomica nedirecționată.

CONŢINUT

1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce este proteomica orientată
3. Ce este proteomica indispensabilă
4. Asemănări între proteomică țintită și nedirijată
5. Comparație comparativă comparativă - Proteomică orientată vs non-orientată în formă tabulară
6. rezumat

Ce este proteomica orientată?

După cum indică și numele, proteomica vizată vizează o proteină specifică sau o peptidă într-un amestec complex de proteine ​​pentru analiză. Apoi analizează prezența și cantitatea de proteină specifică preselectată. Această metodă este posibilă numai pentru o probă sau pentru mai multe eșantioane. Această metodă este potrivită chiar și pentru un grup specific de proteine. Rezultă date mai precise, cantitative și mai sensibile. Mai mult, spectrometria de masă cuplată cu proteomica vizată produce măsurători mai precise și mai fiabile. Această metodă utilizează spectrometrul de masă triple quadrupol (QQQ) pentru analiza sa.

Figura 01: Proteomică

Proteomica vizată este o metodă potrivită dacă doriți să verificați dacă o țintă de knockdown este de fapt bătut în jos sau când doriți să cuantificați o anumită proteină / peptidă în serul de sânge, în lichidul cerebral sau în celulă de liză etc. Puteți, de asemenea, să o utilizați dacă doriți pentru a verifica dacă o anumită proteină este exprimată diferențiat între eșantioane sau în timpul unui experiment în timp.

Ce este proteomica indispensabilă?

Proteomica indispensabilă, așa cum menționează numele, nu vizează o anumită proteină sau peptidă pentru analiza ei. Discuție proteomică este un alt nume pentru proteomica indispensabilă. De fapt, este o analiză mai "globală". În general, efectuarea de proteomici indirecte este de a răspunde la întrebarea "ce proteine ​​sau proteine ​​sunt în acest eșantion sau mai multe eșantioane?". Această metodă nu este sensibilă ca proteomică vizată. Dar poate identifica și măsura multe proteine, inclusiv proteine ​​noi. Proteomica indispensabilă poate produce atât măsurători cantitative, cât și calitative.

Care sunt asemănările dintre proteomica țintită și nedirijată?

• Proteomica vizată și nedirijată măsoară proteinele din probe.
• Ele sunt importante în analiza proteomelor.
• Aceste metode utilizează spectrometrie de masă.

Care este diferența dintre proteomica țintită și nedirijată?

În primul rând, proteomica vizată este determinarea prezenței și cantității unei proteine ​​sau peptide particulare în amestec complex de proteine. Spre deosebire de proteomica nedirecționată este studiul cantitativ și calitativ al proteinelor prezente într-o probă sau eșantioane fără a viza o anumită proteină. Proteomica vizată este realizată cu proteine ​​preselectate sau direcționate, în timp ce proteomica nedirecționată este efectuată pentru a afla tipurile de proteine ​​din această probă. Mai mult, proteomica vizată este mai sensibilă decât proteomica nedirecționată.

Rezumat - Proteomică țintă vs. nedorită

Pentru a rezuma, proteomica vizate și nedirecționate sunt două tipuri de studii privind proteinele. După cum sugerează numele lor, proteomica vizată vizează o proteină specifică, în timp ce proteomica nedirecționată nu vizează o proteină specifică. Aceasta este diferența dintre proteomica țintită și nedirijată.

Referinţă:

1. "Proteomică țintită". UC Davis Proteomics Core, Disponibil aici.
2. "Proteomica / Introducere în proteomică". Teoria muzicii / moduri - Wikibooks, cărți deschise pentru o lume deschisă, Disponibil aici.

Datorită fotografiei:

1. "Proteomics" De la Xxl7441 la Wikibooks de la Wikibooks - Traducere din en.wikibooks to Commons (Domeniul public) prin Commons Wikimedia