Diferența dintre repararea bazei de excizie și repararea exciziei nucleotidelor

Diferența cheie - Repararea bazei de excizie vs. repararea exciziei nucleotidelor
 

ADN-ul este adesea supus unor pagube datorită diverselor factori interni și externi. Cu toate acestea, sistemele de reparații celulare vor corecta imediat și în mod constant daunele înainte de a deveni mutații sau înainte de a fi transferate în generațiile următoare. Există trei tipuri de sisteme de reparare a exciziei în celule: repararea exciziei nucleotidelor (NER), repararea exciziei de bază (BER) și repararea necorespunzătoare a ADN-ului (MMR) pentru a repara daunele cu ADN-ul singular. Diferența cheie între repararea exciziei de bază și repararea exciziei nucleotidelor este aceea repararea exciziei de bază este un sistem simplu de reparații care funcționează în celule pentru a repara daunele unice nucleotidice provocate endogen in timp ce repararea exciziei nucleotidelor este un sistem complex de reparații care funcționează în celule pentru a repara regiunile comparativ mai mari, deteriorate cauzate exogen.

CUPRINS
1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce este repararea bazei de excizie
3. Ce este Nucleotide Excision Repair
4. Comparație între ele - Repararea bazei de excizie împotriva reparării exciziei nucleotidelor
5. rezumat

Ce este repararea bazei de excizie?

Repararea bazei de excizie este cea mai simplă versiune a sistemului de reparare a ADN pe care celulele o au. Se utilizează pentru a remedia daunele minore în ADN. Bazele ADN sunt modificate datorită deaminării sau alchilării. Când există daune de bază, ADN-ul glicozilază recunoaște și activează sistemul de reparare a exciziei de bază și recuperează-l cu ajutorul enzimei endonucleazei AP, ADN polimerazei și ADN ligazei. Următoarele etape sunt implicate în sistemul BER.

1. Recunoașterea și eliminarea unei baze incorecte sau deteriorate de către o glicozilază a ADN pentru a crea un sit abazic (site-uri cu pierderi de bază - situsuri apiurinice sau apirrimidice).
2. Incizia situsului abasic de către o endonuclează apurinică / apimrimidică
3. Îndepărtarea fragmentului de zahăr rămas printr-o liză sau fosfodiesterază
4. Gap de umplere de către o ADN polimerază
5. Etanșarea poreclei de către o ligază ADN

Figura 01: calea de reparare a exciziei de bază

Ce este Nucleotide Excision Repair?

Nucleotida Excision Repair (NER) este un sistem important de reparare a exciziei ADN în celule. Este capabil să repare și să înlocuiască zonele afectate cu până la 30 de baze în lungime și este îndreptată de către firul șablonului nedeteriorat. Defectele ADN frecvente se produc datorită radiației ultraviolete și NER protejează ADN-ul prin reparația acelor daune imediat înainte de a deveni mutații și trecerea în generațiile viitoare sau de a provoca boli. NER oferă în mod specific protecția împotriva mutațiilor provocate indirect de factori exogeni, cum ar fi carcinogeni de mediu și chimici. NER este văzut în aproape toate organismele și recunoaște daunele care provoacă distorsiuni semnificative în helixul ADN.

Procesul NER implică acțiunea mai multor proteine, cum ar fi XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF, XPG, CSA, CSB etc., și continuă prin mai multe mecanisme asemănătoare tăieturilor și pastelor. Aceste proteine ​​sunt esențiale pentru finalizarea procesului de reparare, iar un defect al uneia dintre proteinele NER este vital și poate provoca sindroame recesive rare: xeroderma pigmentosum (XP), sindromul Cockayne (CS) și forma fotosensibilă a tulburării de păr fragile trichotiodistrofia (TTD).

Figura 02: Repararea nucleului cu excizie

Care este diferența dintre repararea Base Excision Repair și Nucleotide Excision Repair?

Rezolvarea bazei de excizie vs. repararea exciziei nucleotidelor
Repararea bazei de excizie (BER) este un sistem de reparare a ADN-ului care apare în celule.	Nucleotida repararea exciziei (NER) este un alt tip de sistem de reparare a ADN-ului gasit in celule.
Recunoașterea aditivilor ADN
REC repara daunele adductelor mici de ADN.	NER repararea aductelor mari de ADN.
ADN-uri daune
REC recunoaște daunele care nu cauzează distorsiuni semnificative la helixul ADN.	NER recunoaște daunele care provoacă distorsiuni semnificative la helixul ADN.
Cauzele daunelor ADN
BER repararea daunelor cauzate de mutageni endogeni.	NER repară daunele cauzate de mutageni exogeni.
Complexitate
BER este cel mai puțin complex sistem de reparații	Este mai complex decât REC.
Nevoia de proteine
REC nu necesită alte proteine.	NER necesită mai multe produse genetice, în special proteine, pentru a discrimina regiuni deteriorate și nevătămate.
potrivire
REC este adecvată pentru corectarea daunelor unice.	NER este potrivit pentru înlocuirea regiunilor afectate.

Rezumat - Repararea bazei de excizie împotriva reparării exciziei nucleotidelor

NER și BER sunt două tipuri de procese de reparare a exciziei ADN găsite în celule. BER este capabil să repare daunele mici cauzate endogen, în timp ce NER este capabil să repare zonele de vătămare cu până la 30 de perechi de lungimi de bază cauzate în cea mai mare parte exogen. ERR diferă de NER în tipurile de substraturi recunoscute și în evenimentul inițial de scindare. REC poate, de asemenea, să recunoască daunele care nu au fost cauzate de distorsiuni semnificative în helixul ADN, în timp ce NER recunoaște distorsiuni semnificative ale helixului ADN. Aceasta este diferența între repararea exciziei de bază și excizia nucleotidelor.

Datorită fotografiei:
1. "Dna repair base excersion en" Prin LadyofHats - (Domeniul Public) prin Commons Wikimedia
2. "O reprezentare schematică a modelelor pentru calea de reparare a exciziei nucleotidelor controlate de proteinele Uvr" De Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui și Seiki Kuramitsu - (CC BY 1.0) Commons Wikimedia

Referințe:
1. Kim, Yun-Jeong și David M. Wilson. "Prezentare generală a biochimiei de reparare a bazelor de excizie". Farmacologie moleculară curentă. Biblioteca Națională de Medicină din S.U.A., ianuarie 2012. Web. 14 martie 2017.
2. Boer, Jan De, și Jan H. J. Hoeijmakers. "Repararea nucleotidelor și sindroamele umane." Carcinogeneză. Oxford University Press, 01 martie 2000. Web. 28 martie 2017
3. Hoogstraten și colab. Detectarea distrugerii ADN-ului în mod repetat de proteinele nucleare de replicare a nucleotidelor genomice globale XPC ", Journal of Cell Science. Compania de Biologi Ltd, 01 septembrie 2008. Web. 28 martie 2017