Diferența dintre plimbarea cromozomului și săritura

Diferența cheie - cromozomul de mers pe jos vs sărituri
 

Cropul cromozomului și saltul cromozomului sunt două instrumente tehnice folosite în biologia moleculară pentru localizarea genelor pe cromozomi și cartografia fizică a genomului. Cromozomul de mers pe jos este o tehnică folosită pentru a clona o genă țintă într-o bibliotecă genomică prin izolarea repetată și clonarea clonelor adiacente ale bibliotecii genomice. Salturile cromozomiale reprezintă o versiune specială de mers pe cromozomi, care depășește punctele de întrerupere a mersului pe cromozomi. Procesul de mers pe cromozomi poate doar să secvențeze și să înregistreze lungimi mici de cromozomi, în timp ce săriturile cromozomiale permit secvențializarea unor părți mari de cromozomi. Aceasta este diferența cheie dintre mersul cromozomilor și săriturile cromozomiale.

CUPRINS
1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce este Cromosome Walking
3. Ce este Cromosome Jumping
4. Comparație comparați între ele - Cromozomul de mers pe jos vs Jumping
5. rezumat

Ce este Cromosome Walking?

Chromozomul de mers pe jos este o unealtă care explorează regiuni de secvență necunoscute ale cromozomilor prin utilizarea de fragmente de restricție suprapuse. În mersul pe cromozom, o parte a unei gene cunoscute este folosită ca probă și a continuat cu caracterizarea lungimii întregi a cromozomului care urmează să fie mapat sau secvențiat. Aceasta merge de la marker la lungimea țintă. În mersul pe cromozom, capetele fiecărui fragment suprapus sunt folosite pentru hibridizare pentru a identifica următoarea secvență.

Sondele sunt preparate din fragmentele finale de ADN clonat și sunt subclonate. Apoi sunt folosite pentru a găsi următorul fragment suprapus. Toate aceste secvențe care se suprapun sunt utilizate pentru a construi harta genetică a cromozomului și pentru a localiza genele țintă. Este o metodă de analiză a extensiilor lungi de ADN prin fragmente mici suprapuse din biblioteca genomică reconstruită.

Cromozomul de mers pe jos tehnica - Pași

1. Izolarea unui fragment ADN care conține gena sau markerul cunoscut lângă gena țintă

2. Prepararea hărții de restricție a fragmentului selectat și subclonarea regiunii finale a fragmentului pentru utilizare ca probă
3. Hibridizarea sondei cu următorul fragment suprapus
4. Prepararea hărții de restricție a fragmentului 1 și subclonarea regiunii finale a fragmentului 1 pentru a fi utilizată ca o probă pentru identificarea următorului fragment suprapus.
5. Hibridizarea sondei cu următorul fragment suprapus 2

6. Prepararea hărții de restricție a fragmentului 2 și subclonarea regiunii finale a fragmentului 2 pentru a servi ca o probă pentru identificarea următorului fragment suprapus

Treptele de mai sus ar trebui continuate până la gena țintă sau până la capătul de 3 'din lungimea totală a secvenței.

Figura 01: Tehnica de mers pe cromozomi

Cromozomul de mers pe jos este un aspect important al citogenetic în găsirea de SNPs de multe organisme și de analiză a bolilor cu transmitere genetică și găsirea de mutații ale genelor relevante.

Ce este Cromosome Jumping?

Salturile cromozomiale sunt o tehnică utilizată în biologia moleculară pentru cartografierea fizică a genomului organismelor. Această tehnică a fost introdusă pentru a depăși o barieră a mișcării cromozomiale care a apărut la găsirea regiunilor ADN repetitive în timpul procesului de clonare. Prin urmare, tehnica de coborâre a cromozomului poate fi considerată ca o versiune specială a mersului pe cromozomi. Este o metodă rapidă comparativ cu mersul pe cromozomi și permite ocolirea secvențelor ADN repetitive care nu sunt predispuse să fie clonate în timpul plimbării cromozomiale. Salturile cromozomiale îngustă decalajul dintre gena țintă și markerii cunoscuți disponibili pentru cartografierea genomului.

Instrumentul de sărituri cromozomi începe prin tăierea unui ADN specific cu endonucleaze de restricție speciale și prin ligarea fragmentelor în bucle circulare. Apoi un primer conceput dintr-o secvență cunoscută este utilizat pentru a secvența buclele circulare. Acest primer permite jumping și secvențierea într-o manieră alternativă. Prin urmare, poate ocoli secvențele de ADN repetitive și poate trece rapid prin cromozom pentru căutarea genei țintă.

Descoperirea genei codifica pentru boala fibrozei chistice a fost făcută folosind instrumentul de sărituri cromozomiale. Combinați împreună, săriturile cromozomiale și mersul pe jos pot îmbunătăți procesul de cartografiere a genomului.

Figura 02: Jumping cromozomiale

Care este diferența dintre plimbările cu cromozomi și sare?

Cromozomul de mers pe jos vs jumping
Cromozomul este un instrument folosit în biologia moleculară pentru cartografierea genomului și localizarea genelor specifice.	Saritul cu cromozomi este o unealtă folosită pentru cartografierea fizică a genomului și identificarea rapidă a genelor țintă în cromozomi.
Lungimi comparabile ale secvenței
Numai fragmente mici pot fi clonate prin mers pe cromozomi.	Lungimi mai mari ale cromozomilor pot fi cartografiate prin sărituri cromozomiale.
Clonarea ADN-ului repetitiv în cromozomi
Tehnologia cromozomului de mers pe jos are o dificultate în mersul pe jos prin secvențele de ADN repetitive găsite în cromozomi.	Aceasta permite ocolirea secvențelor ADN repetitive. Prin urmare, nu există nici o dificultate atunci când le găsiți în timpul secvențierii.
Factorii care afectează procesele
Succesul procesului depinde de mărimea genomului și de distanța care trebuie să fie "umblată" de la o poziție genomică cunoscută față de gena dorită.	Succesul nu depinde de dimensiunea genomului distanței de la marker la țintă.
Efectele ADN-ului neclonat
Cropul cromozomal poate fi oprit prin fragmente ADN neclonate.	Cel mai mic piccolos pe care îl puteți juca este D4.
Necesitatea unei secvențe cunoscute
Procesul începe cu o gena cunoscută în apropierea țintei.	Procesul necesită un fragment cunoscut pentru proiectarea grundului.

Rezumat - Cromozomul de mers pe jos vs Jumping

Procesul de mers pe cromozomi se aplică frecvent atunci când se știe că o anumită genă este localizată în apropierea unei gene clonate anterior într-un cromozom și este posibilă identificarea ei cu izolarea repetată a clonelor genomice adiacente din biblioteca genomică. Cu toate acestea, atunci când regiuni ADN repetitive sunt găsite în timpul tehnicii de mers pe jos cromozomiale, procesul nu poate fi continuat. Prin urmare, tehnica se rupe de la acel punct. Salturile cromozomiale reprezintă un instrument biologic molecular care depășește această limitare pentru cartografierea genomului. Elimina aceste regiuni ADN repetitive, care sunt dificil de clonat și ajută în cartografierea fizică a genomului. Aceasta este diferența principală dintre mersul pe jos și săriturile cromozomiale.

Referințe:
1. Nakaseko, Yukinobu, Yasuhisa Adachi, Shin-ichi Funahashi, Osami Niwa și Mitsuhiro Yanagida. "Mersul pe cromozomi prezintă o secvență repetitivă foarte omoloagă prezentă în toate regiunile centromere ale drojdiilor de fisiune". Jurnalul EMBO. Biblioteca Națională de Medicină din S.U.A., mai 1986. Web. 22 martie 2017
2. Taheri, Ali. "Cromozomul de mers și sărituri". Progrese în ingineria genetică. OMICS International, 30 octombrie 2013. Web. 22 martie 2017