Diferența dintre cosmid și fagemid

diferența cheie între Cosmid și Phagemid este pe tipul de secvențe pe care le conține. Un cosmid conține un sit cos și o plasmidă. Prin urmare, este un vector hibrid în timp ce un fagemid este o plasmidă care conține o origine F1 a replicării fagului F1.

Cosmidele și fagemidele sunt utilizate pentru scopuri de clonare, în special pentru a clona fragmente mai mari de ADN. Acestea sunt utilizate pe scară largă în special în genele de clonare responsabile pentru producerea de diferite proteine. Cosmidele și fagemidele sunt fie replicate singure ca plasmide, fie sunt ambalate în particule virale și apoi replicate.

CUPRINS

1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce este un cosmid
3. Ce este un fagemid
4. Asemănări între cosmid și fagemid
5. Comparație între ele - Cosmid vs Phagemid în formă tabulară
6. rezumat

Ce este un cosmid?

Un cosmid, referit ca plasmidă hibridă, conține situsuri cos extrase din particule de fagi Lambda și o plasmidă. Aceste situsuri cos sunt fragmente lungi de ADN cu 200 perechi de baze. Prin urmare, ele au capete coezive sau lipicioase care permit plasmidei să se potrivească în ADN-ul viral. Prin urmare, site-urile cos sunt vitale pentru ambalarea ADN-ului.

Există trei site-uri cos;

• situl cosN - implicat în scindarea benzii ADN prin activitatea terminazei
• site-ul cosB - implicat în menținerea terminării.
• site-ul cosQ - implicat în prevenirea degradării ADN-ului prin DNase.

Figura 01: Cosmid

De asemenea, Cosmide poate replica fie ADN monocatenar, fie ADN dublu catenar, folosind o origine adecvată de replicare. Cosmidele conțin, de obicei, gene de rezistență la antibiotice ca markeri pentru selecția transformanților. Astfel, utilizarea unui cosmid ca vector poate facilita clonarea și digestia cu enzimă de restricție a vectorului poate apoi să extragă aceste fragmente.

Ce este un fagemid (fasmidă)?

Phagemid, denumit de asemenea fasmidă, este de asemenea un tip de vector hibrid. Fagemidul conține o origine specială de replicare numită originea f1 a replicării. Originea f1 a extractelor de replicare dintr-un fag f1.

Fagemidul poate replica atât ADN monocatenar, cât și ADN dublu catenar. Replicarea poate avea loc fie ca o plasmidă în timp ce se află în replicare independentă, fie poate fi ambalată în particule de fag și, în final, infectează gazda bacteriană E coli. Când infectați E coli celulele, fagul f1 necesită prezența unui pilus. Prin urmare, sexul pili sunt importante în timpul in vitro ambalarea Fagemidelor.

Care sunt asemănările dintre Cosmid și Phagemid?

• Atât cosmidul cât și fagemidul sunt vectori de clonare utilizați în tehnologia ADN recombinant.
• Cosmid și Phagemid pot replica ADN monocatenar și dublu catenar.
• Ambele pot fi supuse unei replicări independente similare plasmidelor.
• Cosmid și Phagemid pot fi supuse in vitro ambalarea și infectarea celulelor bacteriene.
• Atât Cosmid, cât și Phagemid necesită o origine adecvată de replicare pentru clonare.

Care este diferența dintre cosmid și fagemid?

Cosmid vs Phagemid
Cosmidul este un vector hibrid care conține un situs cos și o plasmidă.	Fagemidul este o plasmidă care conține o origine F1 a replicării fagului F1.
Prezența siturilor cos
Site-urile Cos sunt prezente în cosmid și sunt necesare pentru ambalarea in vitro.	Site-urile cos sunt absente în fagemid.
Prezența originii replicării F1
În cosmid, originea replicării fi poate sau nu poate fi prezentă.	Originea F1 a replicării este prezentă în fagemid.
Prezența genelor rezistente la antibiotice
Genele rezistente la antibiotice sunt prezente în cosmide pentru a identifica transformanții din non-transformanții.	Genele rezistente la antibiotice sunt absente în fagemide.
Cerința de ambalare in vitro
Necesită un site cos.	Ne cere un pui de sex.

rezumat - Cosmid vs fagemid

Cosmidul și fagemidul sunt vectori de clonare utilizați în tehnologia ADN recombinant. Cosmidele sunt vectori hibrizi care conțin capete speciale lipicioase, cunoscute ca site-uri cos. in vitro ambalarea necesită aceste site-uri cos. În timp ce fagmidele sunt plasmide care conțin o origine de replicare f1 extrasă din fag f1. Atât cosmidul cât și fagemidul pot fi supuse replicării independente sau in vitro ambalarea celulelor bacteriene. Acestea sunt diferențele importante dintre cosmid și fagemid.

Referinţă:

1. Qi, H și colab. "Vectorii fagmidi pentru afișarea fagelor: proprietăți, caracteristici și construcții". Jurnalul de Biologie Moleculară, Biblioteca Națională de Medicină din S.U.A., 30 martie 2012. Disponibil aici 
2.Collins, J, și B Hohn. "Cosmidele: un tip de vector de gene de plasmidă plasmidic care poate fi ambalat in vitro în capete de bacterii Lambda". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Biblioteca Națională de Medicină din S.U.A., 1978. Disponibil aici  

Datorită fotografiei:

1.Cosmid (Engleză) "Prin Zlir'a (CC0) via Commons Wikimedia