Diferența între vectorii de inserție și înlocuire

diferența cheie între vectorii de inserție și înlocuire este că vectorul de inserție are capacitatea de a introduce lungimi moderate de ADN străin în timp ce vectorul de înlocuire are capacitatea de a găzdui lungimi mai mari de ADN străin.

Vectorii de fag sunt bacteriofagii utilizați pentru clonare. Există două tipuri de vectori de fagi; ele sunt vectorul de inserție și vectorul de înlocuire. De asemenea, toți vectorii de fag constau din gene neesențiale. Cu toate acestea, aceste gene trebuie să fie eliminate din fagi pentru a facilita inserția de noi ADN-uri străine.

CUPRINS

1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce sunt vectorii de inserție
3. Ce sunt vectorii de înlocuire
4. Asemănări între vectorii de inserție și înlocuire
5. Comparație comparativă comparativă - vectori de inserție vs. înlocuire în formă tabulară
6. rezumat

Ce este un vector de inserare?

Mai întâi de toate, vectorul de inserție este cea mai simplă formă de vectori de clonare lambda. De fapt, este un tip de vector de fag care are un situs de restricție unic introdus în genomul vectorului în poziția de ADN opțional. Mai mult, ADN-ul fagului rămâne fără îndepărtare. Această non-îndepărtare a ADN-ului fagic controlează mărimea inserțiilor (ADN străin) care trebuie clonate în vector. Mai mult, acești vectori sunt utili în clonarea și exprimarea ADNc. GT10, GT11 și Zap sunt exemple ale acestui vector.

Figura 01: Faza Lambda

Vectorul de inserție constă dintr-un singur loc de recunoaștere. Funcția primară a acestui vector este de a dezvolta biblioteci cADN derivate din secvențele de ARNm eucariote. Mai mult decât atât, poate găzdui numai lungimi de ADN străin care variază între 5 și 11 kb. De asemenea, posedă un sit unic de clivare pentru inserarea ADN străin.

Ce sunt vectorii de înlocuire?

Vector de înlocuire sau vector de substituție este un tip de vector de fag dezvoltat de la îndepărtarea unei regiuni de "fragment de umplere" de mijloc a ADN-ului fag. Inserția ADN străină dorită înlocuiește ADN-ul fagului.

Figura 02: Vector de înlocuire

Vectorii de înlocuire sunt importanți în crearea bibliotecilor genomice, cum ar fi EMBL4 și Charon40. Acești vectori pot găzdui o lungime mai mare a ADN-ului străin, variind între lungimile de 08-24kb. Regiunea de umplutură constă, de asemenea, dintr-o genă care face ca vectorul fag să nu fie viabil în interiorul unei gazde bacteriene.

Care sunt asemănările dintre vectorii de inserție și de înlocuire?

  • Vectorii de inserție și înlocuire sunt vectori fagi.
  • Ambele vectori au inserții ADN străine.
  • Ambele sunt utile în crearea bibliotecilor ADN.

Care este diferența dintre vectorii de inserție și de înlocuire?

Inserție vs. vectori de înlocuire

Vectorul de inserție este un tip de vector de fag care are un situs de restricție introdus în genomul fagului la locul ADN-ului opțional. Vectorul de înlocuire este un tip de vector de fag dezvoltat din îndepărtarea unei regiuni de "fragment de umplutură" mijlocie a ADN-ului fag
Dimensiunea fragmentelor de inserare
Lungimea de 05-11 kb Lungime 08-24 kb
Filler de fragmentare
Fără fragment de umplere Fragmentul de umplutură este înlocuit cu o inserție străină
  Funcţie
Important pentru crearea bibliotecilor cADN Important în crearea bibliotecilor genomului
Exemple
GT10, GT11 și Zap sunt exemple EMBL4 și Charon40 sunt exemple
Site-ul de scindare
Există un sit unic de clivaj Zona de scindare conține gene care nu sunt esențiale pentru ciclul litice

Rezumat - Intervale de inserare vs înlocuire

Atât vectorii de inserție cât și de înlocuire sunt două tipuri de vectori de fagi. Ambii vectori au situsuri de restricție care facilitează plasarea de noi inserții ADN străine. Vectorii de inserție sunt importanți în crearea bibliotecilor cADN, în timp ce vectorii de substituție sunt importanți în crearea bibliotecilor genomice. Mai mult, vectorii de inserție pot găzdui inserții ADN cu o lungime moderată. Dar vectorii de înlocuire pot găzdui lungimi mai mari de inserții ADN străine. În ansamblu, aceasta este diferența esențială dintre vectorii de inserție și înlocuire.

Referinţă:

1. Hasty, P, și colab. "Eficacitatea inserției față de orientarea vectorului de înlocuire variază de la diferite loci cromozomiale". Biologie moleculară și celulară, US National Library of Medicine, Dec. 1994, Disponibil aici.
2. "Vectori de introducere a Lambda". Biologie 335 Note de curs - Lambda Vectors, Disponibil aici.
3. "Vector de înlocuire." Vector de înlocuire - Terminologia biologiei moleculare pentru vectorul de înlocuire - GenScript, Disponibil aici.

Datorită fotografiei:

1. "Fag Lambda" de Lizanne Koch - lucrarea proprie cu ChemBioDraw (Domeniul Public) via Commons Wikimedia