Diferența dintre plasmida Ti și Ri

Diferența principală - plasmida Ti vs. Ri

Agrobacterium specii sunt patogeni de plante care induc diferite boli în plantele superioare. Ti (inducerea tumorii) și plasmidele Ri (inducerea rădăcinii) sunt două tipuri de plasmide naturale produse de Agrobacterium specii. Ti plasmide sunt produse de Agrobacterium tumefaciens în timp ce plasmidele Ri sunt produse de către Agrobacterium rhizogenes. Ambele plasmide Ti și Ri constau dintr-o parte a ADN-ului plasmidic cunoscut sub numele de ADN T care este transferat în genomul plantei cu ajutorul unor gene de virulență (vir). principala diferență între plasmida Ti și Ri este aceea Plasmidele Ti induc tumora / coroana în dicot, în timp ce plasmida Ri induce rădăcini păroase. Datorită capacității lor de a infecta plante, atât plasmidele Ti cât și Ri sunt utilizate pe scară largă ca vectori pentru a produce plante transgenice.

Domenii cheie acoperite

1. Ce este Ti Plasmid
- Definiție, structură, producție vectorială
2. Ce este Ri Plasmid
- Definiție, structură, formare vectorială
3. Care sunt asemănările dintre Ti și Ri plasmidă
- Schița caracteristicilor comune
4. Care este diferența dintre Ti și Ri plasmidă
- Compararea diferențelor cheie

Termeni cheie: specie Agrobacterium, inginerie genetică, rădăcini păroase, plasmidă Ri (pRi), ADN T, Ti Plasmid (pTi), Tumor, virusuri genice

Ce este Ti Plasmid

Plasmidul Ti se referă la un tip de plasmidă care permite acest lucru Agrobacterium tumefaciens pentru a infecta plantele, producând o tumoră tumorală / coroană. Astfel, plasmida Ti constă atât în formarea tumorilor, cât și în virulență (Vir) gene. Vir genele sunt responsabile pentru transferul ADN-ului T care contine genele care formeaza tumori in genomul plantei prin excizie si integrare. O plasmidă Ti tipică constă din patru regiuni: regiunea A (ADN-T responsabilă de formarea tumorii), regiunea B (responsabilă de replicare), regiunea C (responsabilă de conjugare) și regiunea D (responsabilă pentru virulență). Genele din regiunea T-ADN controlează producția de hormoni de creștere a plantelor (auxină și agropină), care determină proliferarea celulelor de plante infectate. Ambele capete ale regiunii T-ADN sunt flancate de o secvență de frontieră care conține repetiții directe ale secvențelor de 24 de perechi de baze. Doar marginea dreaptă este indispensabilă pentru transferul T-ADN. Structura plasmidei Ti este prezentată în figura 1.

Figura 1: Plasmida Ti

În Agrobacterium-mediată de transformare a genelor, vectorul este proiectat pe baza plasmidei Ti. Vectorul este alcătuit din secvențe de frontieră T-ADN Vir genele și regiunea T-AD modificată. În timpul modificării regiunii T-ADN, genele responsabile pentru formarea tumorii sunt îndepărtate și înlocuite cu genele străine care urmează să fie transformate.

Ce este Ri Plasmid

Plasmidul Ri se referă la un tip de plasmidă care permite Agrobacterium rhizogenes pentru a infecta celulele pantaloni prin producerea rădăcinilor păroase. Se compune din două fragmente de ADN T, cunoscute sub numele de ADN Tr și ADN T1. Ambele fragmente sunt separate printr-un segment ADN de 15 kb. ADN-ul Tr este similar cu regiunea T-ADN a plasmidei Ti și conține gene care induc producția de hormoni de creștere. Regiunea T1-ADN constă din patru gene: Rola (responsabil pentru formarea rădăcinilor păroase), rolB (induce inițierea rădăcinii și formarea de calus), rolC (promovează creșterea rădăcinilor) și Rold (suprimă creșterea calusului). Transformarea ADN-ului T este indusă de Vir gene. Formarea rădăcinilor păroase prin Agrobacterium rhizogenes este afișat în figura 2.

Figura 2: Rădăcini păroase

Ti plasmidele sunt în mare parte înlocuite cu plasmide Ri în ingineria genetică.

Asemănări între Ti și Ri plasmidă

Ti și Ri plasmidele sunt produse în mod natural de către Agrobacterium.
Ambele tipuri de plasmide provoacă boli în multe plante dicotiledonate.
Ambele plasmide Ti și Ri transferă o parte din ADN-ul plasmidic cunoscut ca ADN T în genomul plantei cu ajutorul genelor virulente (vir).
Dimensiunea plasmidelor Ti și Ri este de aproximativ 200 kb.
Secvențele de reglare ale unor gene găsite în ADN-ul T al ambelor plasmide sunt recunoscute de mecanismele celulare ale plantelor.
Celelalte gene din ADN-ul T constau din secvențe reglatoare procariotice.
Datorită capacității de a infecta celulele de plante, ambele plasmide Ti și Ri sunt utilizate în ingineria genetică pentru a produce plante transgenice.

Diferența dintre plasmida Ti și Ri

Definiție

Plasmida Ti: Plasmida Ti este un tip de plasmidă care permite bacteriilor să infecteze plantele, producând o tumoare / tumoare de gonadei.

Ri Plasmid: Plasmidul Ri este un tip de plasmidă care permite bacteriilor să infecteze celulele de plante prin producerea rădăcinilor păroase.

Tip de Agrobacterium specie

Plasmida Ti: Ti plasmidă este produsă de Agrobacterium tumefaciens.

Ri Plasmid: Ri plasmidă este produsă de Agrobacterium rhizogenes.

mărimea

Plasmida Ti: Dimensiunea plasmidei Ti este de 180-205 kb.

Ri Plasmid: Dimensiunea plasmidei Ri este de 250 kb.

Tipul bolii

Plasmida Ti: Plasmidul Ti induce formarea de gonda / tumora coroanei.

Ri Plasmid: Plasmidul Ri induce formarea rădăcinilor păroase.

Tip de studiu

Plasmida Ti: Ti plasmide sunt mai puțin studiate în comparație cu plasmidele Ri.

Ri Plasmid: Ri plasmidele sunt bine studiate.

Concluzie

Plasmida Ti și plasmida Ri sunt două tipuri de plasmide găsite în diferite Agrobacterium specii. Ambele plasmide Ti și plasmidele Ri constau din ADN T și Vir gene. Ti plasmide pot fi găsite în Agrobacterium tumefaciens care induce formarea de tumori gall coroana. Ri plasmidele pot fi găsite în Agrobacterium rhizogenes care induce formarea rădăcinilor păroase. Diferența principală dintre plasmida Ti și Ri este tipul de boală provocat de fiecare tip de plasmide.

Referinţă:

1. "Lectura 26: Plasmide Ti și Ri" NPTEL, IIT Guwahati, disponibil aici.
2.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. "Agrobacterium rhizhogenes și Ri Plasmid." Disponibil aici.

Datorită fotografiei:

1. "Ti plasmid" Prin Mouagip - Activitate proprie (CC0) prin Wikimedia Commons
2. "Agrobacterium rhizogenes" De FruitDefendu - Activitate proprie (CC BY-SA 3.0) prin Wikimedia Commons

Ştiinţă