Diferența dintre VNTR și STR

Diferența principală - VNTR vs STR

ADN-ul repetat este modelul de acizi nucleici care apar în mai multe copii în întregul genom. Ele formează proporții majore ale ADN-ului nuclear în eucariote. Repetițiile tandem sunt unul dintre principalele tipuri de ADN repetitiv care copiază unitățile de secvențe repetitive care se află adiacente unul altuia, formând un bloc de nucleotide. VNTR (repetițiile cu tandem variabil) și STR (repetiții tandem scurte) sunt două tipuri de repetări tandem găsite în genomul eucariot. VNTR este un tip de ADN minisatelit, în timp ce STR este un tip de ADN microsatelit. principala diferență între VNTR și STR este asta unitatea repetitivă a VNTR este de 10-60 perechi de baze, în timp ce unitatea repetitivă a STR este de 2-6 perechi de baze.

Domenii cheie acoperite

1. Ce este VNTR
- Definiție, caracteristici, importanță
2. Ce este STR
- Definiție, Caracteristici, Importanță
3. Care sunt asemănările dintre VNTR și STR
- Schița caracteristicilor comune
4. Care este diferența dintre VNTR și STR
- Compararea diferențelor cheie

Termeni cheie: Genetică criminalistică, Microsatelit, Minisatelit, Unități nucleotidice repetate, STR, Repetări tandem, VNTR

Ce este VNTR

VNTR se referă la un tip de repetări tandem în care se repetă o serie scurtă de nucleotide (10-60 perechi de baze) de câte ori variază într-un anumit locus. Prin urmare, VNTR este, de asemenea, cunoscut sub numele de minisatellites. VNTR-urile sunt intercalate în cromozomii genomului eucariot. În general, numărul de unități repetate într-un VNTR variază între persoane. Prin urmare, lungimea matricei formate de VNTR-uri variază de asemenea între indivizi. Pe măsură ce numărul variat de cromozomi este moștenit de la părinți, aceștia pot fi utilizați în identificarea părintească sau personală. Variațiile VNTR în șase persoane sunt prezentate în figura 1.

Figura 1: Variația VNTR la persoanele fizice

VNTR-urile sunt primele tipuri de polimorfisme utilizate în profilaxia ADN-ului pentru a determina caracteristicile ADN ale unei anumite persoane. Acestea sunt, de asemenea, utilizate ca markeri genetici în RFLP (polimorfism de lungime a fragmentelor de restricție), o tehnică care utilizează PCR, electroforeza în gel și producția de modele de benzi prin sudură blotting.

Ce este STR

STR se referă la un tip de repetări tandem în care se repetă o serie scurtă de nucleotide (2-6 perechi de baze) de câte ori variază într-un anumit locus. STR sunt un tip de microsatelit și sunt, de asemenea, cunoscute sub numele de repetări de secvențe scurte (SSR) în genetica plantelor. Unitățile repetate compuse dintr-o singură nucleotidă sunt cunoscute ca polimorfismul unic de nucleotide (SNP). STR sunt cele mai frecvente tipuri de polimorfisme genetice analizate în prezent în genetica medico-legală. Este prezentat profilul ADN cu utilizarea STR ca markeri genetici figura 2.

Figura 2: Profilarea ADN-ului

Mutațiile din unele regiuni STR conduc la boli genetice, cum ar fi sindromul fragil X și boala Huntington.

Asemănări între VNTR și STR

VNTR și STR sunt două tipuri de repetări tandem.
Atât VNTR cât și STR sunt regiuni structurale ale genomului eucariot.
Atât VNTR cât și STR constau din ADN necodificat.
AmbeleVNTR și STR sunt moștenite de la părinți.
Atât VNTR, cât și STR sunt compuse din secvențe repetitive, aranjate adiacent unul la celălalt într-o matrice.
Atât VNTR cât și STR produc polimorfismul genetic.
Atât VNTR cât și STR sunt răspândite în întregul genom.
Atât VNTR cât și STR sunt utilizate ca markeri genetici în genetica medico-legală.
Mutațiile în VNTR și STR conduc la boli genetice.

Diferența dintre VNTR și STR

Definiție

VNTR: VNTR este un tip de repetiție tandem în care se repetă o serie scurtă de nucleotide (10-60 perechi de baze) de câte ori variază într-un anumit loc.

STR: STR este un tip de repetiție tandem în care se repetă o serie scurtă de nucleotide (2-6 perechi de baze) de câte ori variază într-un anumit loc.

Numărul de nucleotide repetate

VNTR: VNTR este format din perechi de 10-60 de baze.

STR: STR constă din 2-6 perechi de baze.

Tip de ADN repetitiv

VNTR: VNTR este un tip de ADN minisatelit.

STR: STR este un tip de ADN microsatelit.

Numărul de repetări

VNTR: VNTR este format din 10-1500 repetări în matrice.

STR: STR constă în 5-200 repetări în matrice.

Dimensiunea matricei

VNTR: VNTR formează o matrice de 0,5-15 kb.

STR: STR formează o serie de 10-1000 bp.

Complexitatea matricei

VNTR: VNTR produce matrice eterogene.

STR: STR produce matrice omogene.

Concluzie

VNTR și STR sunt două tipuri de repetări tandem care formează rețele de unități repetitive adiacente din genomul eucariot. VNTR constă în comparativ cu unități repetitive lungi de nucleotide (10-60 perechi de baze). STR constă din unități repetate scurte de nucleotide (2-6 bp). Principala diferență dintre VNTR și STR este lungimea unităților repetate ale fiecărui tip de repetări tandem.

Referinţă:

1. "Repetarea tandemului cu număr variabil" Subiecte ScienceDirect, disponibile aici.
2. "Știința geneticii medico-legale" CRG - Consiliul pentru Genetică Responsabilă, disponibil aici.

Datorită fotografiei:

1. "D1S80Demo" de către PaleWhaleGail la Wikipedia în engleză (CC BY-SA 3.0) prin Wikimedia Commimedia
2. "Etapele de amprentare genetică" de Sneptunebear16 - Muncă proprie (CC BY-SA 4.0) prin Wikimedia Commons

Ştiinţă