Termenul gel de stivuire și gel de separare sunt utilizate pentru a explica tehnica SDS-PAGE. SDS-PAGE sau electroforeza pe gel de dodecil sulfat de sodiu-poliacrilamidă este o tehnică de laborator care se utilizează pentru a separa moleculele de proteine pe baza greutății lor moleculare. Teoria din spatele acestei tehnici este că proteinele cu greutăți moleculare diferite prezintă rate de migrație diferite; moleculele cu greutate moleculară mică migrează mai rapid, în timp ce moleculele cu greutate moleculară mare migrează încet. Mediul pentru migrație este un gel. Există două tipuri de geluri denumite gel de stivuire și gel de separare. diferența cheie între gelul de stivuire și gelul de separare este acela pH-ul gelului de stivuire este de 6,8, în timp ce pH-ul gelului de separare este de 8,8.
1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce este Stacking Gel
3. Ce este Gelul separator
4. Relația dintre gelul de stivuire și gelul separator
5. Comparație comparați între ele - Gel de stivuire vs gel separator în formă tablă
6. rezumat
Gelul de înălțare este un gel poliacrilamidic scăzut concentrat, care este plasat pe vârful unui gel de separare mai concentrat (gel de separare) în tehnica SDS-PAGE. Gelul de stivuire este utilizat pentru a îmbunătăți rezoluția electroforezei. Rezoluția crește datorită diferenței dintre concentrațiile gelului de stivuire și gelului de separare care afectează proteinele din probă. Deoarece concentrația de poliacrilamidă în gelul de stivuire este scăzută, dimensiunea porilor este mai mare. Acest lucru ajută, de asemenea, la creșterea separării.
Gelul de stivuire este un gel de poliacrilamidă, cu pori mari de aproximativ 7% poliacrilamidă. Acești pori nu acționează ca o barieră considerabilă pentru moleculele mari de proteine. Prin urmare, acest gel afectează ușor mobilitatea acestor proteine. Aceasta face separarea în funcție de mobilitatea și dimensiunea proteinei, concentrându-le între două geluri.
Figura 01: Gel acrilamid SDS-PAGE
PH-ul gelului de stivuire este de 6,8. PH-ul său este acid decât cel al gelului de separare cu 2 unități de pH. Acest pH implică o rezistență ionică inferioară, prin urmare o rezistență electrică mai mare. Aceasta provoacă mobilitatea proteinelor decât alte particule încărcate prezente în gel.
Gelul de separare sau gelul de separare a tehnicii SDS-PAGE este un gel de poliacrilamidă foarte concentrat care este plasat pe partea superioară a gelului de stivuire cu concentrație scăzută. Gelul de separare conține o cantitate mare de poliacrilamidă (10%). PH-ul acestui gel este menținut ca pH = 8,8, care este un nivel de pH mai ridicat decât cel al gelului de stivuire.
Figura 02: Un aparat de electroforeză cu gel
Când moleculele de proteine ajung la gelul de separare, migrarea acelor molecule este încetinită, deoarece gelul de separare este un gel cu o concentrație ridicată, cu o dimensiune a porilor mici, care poate acționa ca o barieră considerabilă pentru mișcarea moleculelor de proteine. Aceasta încetinire permite altor proteine să migreze lent pentru a prinde din urmă, rezultând o bandă îngustă, concentrată între cele două geluri.
Gel de stivuire vs gel separator | |
Gelul de stivuire este un gel de poliacrilamidă concentrat scăzut, care este plasat pe partea superioară a gelului de separare mai concentrat (gel de separare) în tehnica SDS-PAGE. | Gelul de separare sau gelul de separare a tehnicii SDS-PAGE este un gel de poliacrilamidă foarte concentrat care este plasat pe partea superioară a gelului de stivuire cu concentrație scăzută. |
Destinație de plasare | |
Gelul de stingere este plasat pe gelul de separare (separare). | Gelul separator este plasat pe fundul recipientului utilizat pentru electroforeza pe gel. |
Concentraţie | |
Concentrația gelului de stivuire este mare. | Concentrația gelului de separare este scăzută. |
Conținut de poliacrilamidă | |
Gelul de stivuire conține aproximativ 7% poliacrilamidă. | Gelul separator conține aproximativ 10% poliacrilamidă. |
pH | |
PH-ul gelului de stivuire este de 6,8. | PH-ul gelului de separare este 8,8. |
Dimensiunea porilor | |
Dimensiunile mari ale porilor sunt prezente în gelul de stivuire. | Mărimile de pori mici sunt prezente în gelul de separare. |
Rezoluţie | |
Gelul de stivuire oferă o rezoluție mai bună. | Gelul de separare dă o rezoluție slabă. |
Gelul de ștergere și gelul de separare sunt două tipuri de geluri de poliacrilamidă utilizate pentru a obține o mai bună separare a moleculelor de proteine într-o probă dată. Diferența dintre gelul de stivuire și gelul de separare este că pH-ul gelului de stivuire este de 6,8, în timp ce pH-ul gelului de separare este de 8,8.
1. "Electroforeza gelului poliacrilamidic" Electroforeza gelului poliacrilamidei (teorie): Biologie moleculara Laboratorul virtual II: Biotehnologie si inginerie biomedicala: Laboratorul virtual Amrita Vishwa Vidyapeetham. Disponibil aici
2. "Cum funcționează SDS-PAGE" Bitesize Bio, 16 februarie 2018. Disponibil aici
3. "gel de stivuire SDS-PAGE - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew)" Site-uri Google. Disponibil aici
1.SDS-PAGE Acrylamide gel'By Bensaccount la Wikipedia în engleză, (CC BY 3.0) prin intermediul Commons Wikimedia
2. "Aparat de electroforeză de gel" De Jeffrey M. Vinocur - Lucrare proprie, (CC-BY 2.5) prin intermediul Commons Wikimedia