Diferența dintre arborele filogenetic înrădăcinat și dezrădăcinat

Diferența principală - Arborele filogenetic înrădăcinat față de Unrooted Tree
 

Filogenia este un câmp important care explorează viața pe pământ în timp. Acesta dezvăluie legătura dintre organisme cu strămoșii și descendenții lor. Relațiile dintre organisme sunt reprezentate schematic prin diverse reprezentări arborescente, cum ar fi dendograma, cladograma, fenograma, filograma etc. Un arbore filogenetic este o diagramă de ramificație asemănătoare unui arbore care explică relațiile filogenetice dintre organisme cu cantitatea de distanță evolutivă. Există două tipuri principale de arbori filogenetici, cunoscuți ca fiind înrădăcinați și dezrădăcinați. Diferența esențială dintre arborele filogenetic înrădăcinat și dezrădăcinat este asta copac înrădăcinat arată cel mai bazat strămoș al copacului in timp ce nerădăcinoși arborele filogenetic nu prezintă o rădăcină ancestrală.

CUPRINS
1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce este un copac filogenetic înrădăcinat
3. Ce este un copac filogenetic dezrădăcinat
4. Comparație de la o parte la alta - copac filogenetic înrădăcinat vs.
5. rezumat

Ce este un copac filogenetic înrădăcinat?

Un arbore filogenetic înrădăcinat servește ca o diagramă utilă care prezintă istoria evoluționistă. Are un nod bazal numit rădăcină, reprezentând strămoșul comun al tuturor grupurilor de copaci. Rădăcina unui copac este considerată cel mai vechi punct din arbore, care reprezintă ultimul strămoș comun al tuturor grupurilor incluse în arbore. Prin urmare, un copac înrădăcinat arată direcția timpului evolutiv. De la o singură specie de copac înrădăcinat, strămoșul comun sau strămoșul de specie poate fi găsit prin urmărirea înapoi la nodul bazal. Deoarece arborele înrădăcinat descrie direcția timpului evolutiv, este ușor să găsiți grupurile mai vechi sau mai noi. Un copac înrădăcinat poate fi folosit pentru a studia întregul grup de organisme. Înrădăcinarea corectă a unui arbore filogenetic este un factor important și esențial, deoarece înrădăcinarea inexactă poate duce la interpretări greșite ale schimbărilor genetice între organisme și direcționalitatea lor asupra evoluției.

Figura 01: Un arbore fylogenetic înrădăcinat

Ce este un copac filogenetic dezrădăcinat?

Un arbore filogenetic necruțător este o diagramă filogenetică care nu are un strămoș comun sau un nod bazal. Acest tip de copac nu indică originea evoluției grupurilor de interese. Acesta descrie numai relația dintre organisme, indiferent de direcția liniei temporale evolutive. Prin urmare, este dificil să se studieze relațiile evolutive ale grupurilor în raport cu timpul, folosind un copac necruțător.

Există două modalități principale de rădăcină a unui arbore fylogenetic dezrădăcinat. Sunt

• Găsirea unui outgroup - Aceasta necesită cunoștințe anterioare despre relațiile dintre taxoni. Apoi, un taxon care se află în afara grupului poate fi folosit ca un outgroup pentru a desena un copac filogenetic înrădăcinat

• Găsirea punctului sau distanței - Punctul central al celor mai îndepărtate două taxoni din arbore poate fi considerat o rădăcină pentru arborele filogenetic.

Figura 02: Un arbore fylogenetic necotat

Care este diferența dintre arborele filogenetic înrădăcinat și dezrădăcinat?

Rădăcină vs arbore fylogenetic dezrădăcinat
Un copac filogenetic înrădăcinat este o diagramă care arată ultimul strămoș comun al grupurilor.	Un arbore filogenetic descoperit arată relațiile dintre organisme, fără a arăta strămoșul comun.
Nodul
Are un nod (root).	Nu are un nod.
Direcția Evoluției
Are o direcție care să indice timpul evolutiv.	Nu specifică o relație evolutivă.
Atitudinea față de alții
Arborele permite determinarea relației dintre descendenți dintre grupuri.	Copacul nu permite să vorbească despre relația dintre strămoși și descendenți.

Rezumat - Arborele filogenetic înrădăcinat și rădăcină

Un arbore filogenetic reprezintă căile evolutive și conexiunile dintre organisme utilizând diagrame asemănătoare cu arbori. Frunza filogenetică poate fi înrădăcinată sau dezrădăcinată. Un copac înrădăcinat are un nod la bază, reprezentând strămoșul comun care leagă toate grupurile de interese. Un arbore necorelat arată relațiile dintre organisme. Cu toate acestea, nu descrie strămoșul comun pe care îl împărtășesc toate grupurile. Aceasta este diferența dintre arborele filogenetic înrădăcinat și neînlocuit.

Referințe:
1. "Faptele" copacului: copaci rădăcini față de copaci necruțători ". Centrul Național de Informare Biotehnologică. Biblioteca Națională de Medicină din S.U.A., n.d. Web. 04 aprilie 2017
2. Graham, Sean W., Richard G. Olmstead și Spencer C. H. Barrett. "Înrădăcinarea copacilor filogenetice cu grupuri distanțate îndepărtate: un studiu de caz de la monocotidele comelinoide" Biologie moleculară și evoluție. Oxford University Press, 01 octombrie 2002. Web. 04 aprilie 2017