Diferența dintre knockout-ul genei și knockdown

diferența cheie între knockout gena și knockdown este că gena knockout este o tehnică în cazul în care gena de interes este complet eliminat (starea inoperantă) pentru a studia funcțiile genei în timp ce gena knockdown este o altă tehnică în cazul în care gena de interes este tăcut pentru a investiga rolul genei particulare într-un sistem biologic.

Diferite tehnici genetice sunt în funcțiune pentru a investiga funcționarea genelor în cadrul sistemelor biologice vii. Gene knockout și knockdown sunt două astfel de tehnici. Aceste tehnici ajută oamenii de știință să identifice aspectele funcționale ale diferitelor gene în organismele vii.

CUPRINS

1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce este Gene Knockout
3. Ce este Gene Knockdown
4. Asemănări între gene knockout și knockdown
5. Comparație de la o parte la alta - Gene Knockout vs. Knockdown în formă tabulară
6. rezumat

Ce este Gene Knockout?

Gene knockout este o tehnică genetică care face una sau mai multe gene inoperante în organisme vii. Acesta este, de asemenea, un proces de oprire sau ștergere a unei gene a unui organism. Aplicarea primară a acestei tehnici este de a studia funcția genei. Procesul evaluează efectul genei pierdute sau eliminate. Procesul de knockout implică, de asemenea, anumite enzime și tehnici de îmbinare.

Figura 01: Gene Knockout

Există puține variații în tehnica knock-out a genei, pe baza numărului de gene implicate. Sunt dublu knock-out (knock-out de două gene), triplu knock-out (knock-out de trei gene) și cvadruple knockout (knock-out de patru gene). Nodul de gene este în continuare clasificat în două grupe; heterozigote și knockouts homozigote.

Ce este Gene Knockdown?

Knockdownul genei este o procedură experimentală în care această procedură suprimă sau reduce expresia unei anumite gene sau gene ale unui organism. Gene silențios este definiția comună pentru knockdown-ul genei. În timpul acestei proceduri, activarea sau degradarea mARN-ului produs implică interferența ARN (ARNi), ARN-ul mic de interferență (siRNA) și ARN-ul scurt al acului (shRNA).

Figura 02: Silencing-ul genei

Utilizarea primară a knockdown-ului genei este de a investiga rolul genei particulare în sistemul biologic. Prin urmare, această tehnică realizează studiul oncogene (Bcl-2 și P53) și genelor care cauzează boli neurologice, infecții virale și boli ereditare.

Care sunt asemănările dintre knockout-ul de gen și knockdown?

• Atât knockout-ul genotipului cât și knockdown-ul genei sunt tehnici genetice.
• Aceste două tehnici pot împiedica exprimarea genei.
• Utilizarea primară a ambelor tehnici este de a investiga funcția genei de interes.
• Ambele sunt capabile să identifice diferite condiții de boală (genetice).
• Ambele ar putea fi utilizate pentru una sau mai multe gene de interes.

Care este diferența dintre gene Knockout și knockdown?

Gene Knockout vs Knockdown
Gene knock-out este in functiune de gene (eliminarea genelor din ADN) a unui organism prin diferite tehnici genetice.	Dăunător de gene este o procedură experimentală de suprimare (reducere sau tăcere) a expresiei unei gene sau gene specifice unui organism.
Funcţie
Facilitează studiul funcțiilor genelor prin analizarea rezultatelor genei pierdute.	Facilitează studiul oncogenelor, genelor care cauzează boli neurologice, infecții virale și boli ereditare.
Implicarea agenților ARN
Implicarea agenților ARN este nesemnificativă în această tehnică.	Procesul implică agenții cum ar fi siARN, shRNA și ARNi pentru a inactiva ARNm.
Utilizarea agenților chimici
Sunt utilizați agenți enzimatici.	Nu sunt utilizați astfel de agenți chimici.
Efectul asupra genei
Înlătura complet gena din ADN.	Suprimați sau tăiați gena.
Clasificare
Knockout-ul dublu, knock-out triplu și knock-out-ul cvadruplu și knockout heterozygos și homozigot sunt diferite tipuri de knock-out gene.	Nu există astfel de sisteme de clasificare disponibile pentru tăcerea genelor.

Rezumat - Gene Knockout vs Gene Knockdown

Cele două tehnici discutate aici; gena knockout și knockdown, sunt metode pentru a investiga funcțiile diferitelor gene. Gene knock-out complet face gena inoperant în timp ce knockdown gena tăcere gena de interes. Cu toate acestea, ambele proceduri împiedică exprimarea genei. Diferiți agenți sunt capabili să realizeze aceste două procese. Derularea genei este un tip de ștergere, în timp ce knockdown-ul genelor este un tip de inactivare. Aceasta este diferența dintre eliminarea genei și knockdown.

Referinţă:

1.Shaffer, Catherine. Gene Knockout versus knockdown. "News-Medical.net, 12 februarie 2018. Disponibil aici  
2. "Gene Knockout", Nature News, Nature Publishing Group. Disponibil aici

Datorită fotografiei:

1. "Miscarea de la cuptorul 5006-300" prin Maggie Bartlett, NHGRI. (Domeniul Public) prin Commons Wikimedia 
2. "ARNi-simplificat" de la Matzke MA, Matzke AJM (2004) Plantarea semințelor unei noi paradigme. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC de 2,5) prin intermediul Commons Wikimedia