Diferența dintre ADN-ul genomic și izolarea plasmidei ADN-ului

diferența cheie între ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmidic este faptul că izolarea genomică a ADN-ului vizează extracția ADN-ului genomic în timp ce izolarea ADN-ului plasmidic vizează extracția ADN-ului plasmidic al bacteriilor.

Izolarea ADN este un proces chimic care a folosit pentru a izola ADN-ul de la diferite specii sau de la diferite probe. Izolarea ADN-ului este importantă în tehnicile de biologie moleculară din aval, cum ar fi electroforeza în gel, reacția în lanț a polimerazei și tehnicile de secvențiere a ADN-ului. Prin urmare, izolarea ADN-ului este un proces chimic esențial în studiile biologice moleculare. În funcție de scopul cercetării, uneori este necesară izolarea ADN-ului genomic. În plus, unele studii se concentrează pe izolarea plasmidei ADN din bacterii. Izolarea genomică a ADN-ului este procesul de izolare a ADN-ului genomic dintr-o probă procariotică sau eucariotă. Etapele izolației diferă în funcție de tipul celulei în care se izolează ADN-ul. Izolarea ADN-ului plasmidic este procesul de izolare a ADN-ului plasmidic de la o celulă bacteriană. În comparație cu izolarea ADN-ului genomic, procesul global este complex în izolarea ADN-ului plasmidic.

CUPRINS

1. Prezentare generală și diferență cheie
2. Ce este Izolarea ADN-ului genomic
3. Ce este Izolarea ADN-ului plasmidic
4. Asemănări între ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmidic
5. Comparație comparativă comparativă - ADN genomic vs. izolarea ADN-ului plasmidic sub formă de tabel
6. rezumat

Ce este Izolarea ADN-ului genomic?

Izolarea genomică a ADN-ului este procesul de extragere a întregului ADN genomic al unui organism. Acest proces implică trei evenimente principale. Acestea sunt liza celulară sau liza nucleară, degradarea sau proteoliza proteinelor și precipitarea ADN-ului genomic. Etapa de lizare poate diferi în funcție de tipul celular. În prokariote, deoarece există un perete de celule peptidoglican, prima etapă ar trebui să fie defalcarea peretelui celular. Pe de altă parte, în eucariote, etapa de liză implică descompunerea membranei plasmatice și a membranei nucleare pentru a scoate ADN-ul la exterior. Dimpotrivă, pașii specifici sunt esențiali pentru a liza pereții celulelor plantelor și fungilor.

Figura 01: Izolarea ADN-ului genomic

În consecință, odată ce etapa de liză se termină, eventual ADN va veni la supernatant. Simultan, degradarea proteinei are loc, de asemenea, în soluție din cauza adăugării proteinazei K. Următoarea etapă este separarea ADN-ului genomic și a proteinelor degradate unele de altele. Prin urmare, proteinele degradate se separă prin precipitare, permițând ADN-ul genomic să rămână în supernatant. După precipitarea proteinelor, ADN-ul genomic poate fi precipitat și resuspendat într-un tampon adecvat până când este necesar pentru experiment.

ADN-ul genomic, care este ADN liniar, conține toate informațiile genetice ale unui organism. Cu alte cuvinte, genomul este materialul de ereditate al unui organism viu care este responsabil pentru toate activitățile structurale și funcționale ale celulei. Se compune atât din secvențele ADN care codifică, cât și din cele necodificate. Când se izolează ADN-ul genomic, acesta cuprinde întregul genom al organismului.

Ce este Izolarea ADN-ului plasmidic?

Izolarea ADN-ului plasmidic este un proces special și mai complicat de izolare a ADN-ului. Plasmidele sunt ADN extrachromozomal prezent în majoritatea celulelor bacteriene. Acestea sunt ADN circular latente care susțin bacteriile să supraviețuiască în condiții de mediu dure. ADN-ul plasmidic constă din gene rezistente special care oferă avantaje suplimentare bacteriilor, cum ar fi rezistența la antibiotice, proprietățile virulenței și proprietățile toxice.

Figura 02: Izolarea ADN-ului plasmidic

Izolarea ADN-ului plasmidic implică, de asemenea, trei procese principale; liza celulară, proteinoliza și precipitarea ADN. Deși mecanismul biochimic de izolare este similar cu cel al izolației genomice a ADN-ului, procesul este mai complex decât acesta. Procesul de liza celulară este cel mai important proces în această procedură. Cel mai important, ADN-ul genomic și ADN-ul plasmidic nu trebuie amestecate între ele. Prin urmare, un procedeu de liză mult mai blând încorporează în procedura de izolare a plasmidei ADN. Prin urmare, în majoritatea procedurilor de izolare a ADN-ului plasmidic se utilizează detergentul; dodecil sulfat de sodiu pentru liza celulară.

Care sunt asemănările dintre ADN-ul genomic și izolarea plasmidei ADN-ului?

• Analiza ADN-ului genomic și plasmida ADN-ului se concentrează pe extracția ADN-ului unui organism.
• De asemenea, ambele urmeaza acelasi proces global care include liza celulara, degradarea proteinei si precipitarea ADN.
• Mai mult, ADN-ul rezultat al ambelor procese este important pentru procesele din aval.
• Mai mult, ambele procese de izolare includ etapele de purificare și stocare a ADN-ului în condiții de depozitare specificate.
• În plus, proteina K este utilizată în ambele metode pentru a degrada proteinele.

Care este diferența dintre ADN-ul genomic și izolarea plasmidei ADN-ului?

Analiza genomică a ADN-ului se concentrează pe extragerea întregului ADN genomic al organismului țintă în timp ce izolarea ADN-ului plasmidic se concentrează pe izolarea numai a ADN-ului plasmidic din speciile bacteriene particulare. Prin urmare, aceasta este diferența esențială dintre ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmidic. Mai mult, o altă diferență între ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmidic este în procedură. Izolarea genomică a ADN-ului este o procedură mai puțin complexă comparativ cu izolarea plasmidei ADN. Prin urmare, atunci când se izolează ADN-ul plasmidic, este necesar să se ia măsuri de precauție pentru a preveni amestecarea ADN-ului genomic și plasmidic între ele.

Infograohicul de mai jos oferă detalii suplimentare privind diferența dintre ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmidic.

Rezumat - ADN-ul genomic vs Izolarea plasmidei ADN-ului

Izolarea ADN-ului este un proces important în tehnicile de biologie moleculară. Există două tipuri de ADN, și anume ADN genomic și ADN plasmidic (ADN extra-cromozomial). Pe baza acestei cerințe, s-au efectuat anumite proceduri pentru izolarea ADN-ului genomic, în timp ce unele proceduri se concentrează pe izolarea numai a ADN-ului plasmidic din bacterii. Prin urmare, etapele implicate în ambele procese diferă ușor unele de altele. Cu toate acestea, procesul global este același în ambele izolații. ADN-ul izolat al ambelor procese are o utilizare imensă în procesele din aval, cum ar fi clonarea, electroforeza în gel și reacțiile în lanț polimerazice. La sfârșitul protocolului de izolare a ADN-ului genomic, întregul ADN genomic al organismului poate fi izolat ca produs final în timp ce la sfârșitul protocolului de izolare a plasmidei ADN-ului, ADN-ul plasmidic al respectivei bacterii poate fi izolat ca produs final. Prin urmare, aceasta este diferența dintre ADN-ul genomic și izolarea ADN-ului plasmidic.

Referinţă:

1. "Extragerea ADN-ului de la bacterii". Extragerea ADN-ului de la bacterii. Disponibil aici 

Datorită fotografiei:

1. "Extragerea ADN-ului" de Joo Nath - Lucrare proprie, (CC BY-SA 4.0) prin intermediul Commons Wikimedia 
2. "Miniprep de plasmidă" Prin Retama - Lucrare proprie, (CC BY-SA 4.0) prin intermediul Commons Wikimedia