Diferența dintre genomică și proteomică
Share
Diferența principală - genomică vs. proteomică
Genomica, proteomica și metabolomica sunt domeniile implicate în studiul și clasificarea lucrurilor vii prin intermediul genomului lor, produsele proteice sintetizate pe baza instrucțiunilor genetice și tipul de molecule pe care le metabolizează. Genomica și proteomica sunt domenii apropiate. principala diferență între genomică și proteomică este asta genomica este studiul întregului set de gene din genomul unei celule, în timp ce proteomica este studiul întregului set de proteine produse de celulă. Metabolomica, pe de altă parte, este studiul întregului set de compuși cu greutate moleculară mică care servesc ca substraturi și subproduse ale reacțiilor enzimatice ale unei celule.
Domenii cheie acoperite
1. Ce este Genomics
- Definiție, tehnici, clasificare
2. Ce este proteomica?
- Definiție, tehnici, clasificare
3. Care sunt asemănările dintre genomică și proteomică
- Schița caracteristicilor comune
4. Care este diferența dintre genomică și proteomică
- Compararea diferențelor cheie
Termeni-cheie: Genele, Genomica, Proiectul genomului uman (HGP), Proiectul Human Proteome (HPP), Proteinele, Proteomul, Proteomica
Ce este Genomics
Genomica se referă la studiul întregului set de gene într-un genom. Genomul este setul complet de informații genetice ale unui organism, compus în principal din ADN. Tehnicile de mare viteză sunt folosite în genomică pentru a cartografia, secvența și analiza genomului. Tehnicile implicate în genomică includ strategii de secvențiere a genei, cum ar fi secvențierea genei direcționate, secvențierea genunchiului întreg al gambelor, construirea tagurilor de secvențe exprimate (EST), identificarea polimorfismelor singulare de nucleotide (SNPs) și analiza și interpretarea datelor secvențiate folosind diferite programe și baze de date. Se prezintă pașii majori ai secvențializării armei figura 1.
Figura 1: Secvențierea broșurilor de mediu (ESS)
(C) extracție și liză de ADN, (D) clonare și bibliotecă, (D) secvențiere, (E) asamblare secvență
Cele două domenii principale ale genomicii sunt genomica structurală și genomică funcțională. În structura genomică, structura și pozițiile relative ale genelor sunt studiate în timp genomică funcțională, funcția sau rolul genelor în activitățile metabolice de reglare sunt studiate. Genome Sequencing Projects reprezintă cea mai recentă dezvoltare a genomicii. Proiectul genomului uman (HGP) a fost finalizat în 2003. Obiectivele proiectului Genomului uman au fost:
- La identifica toate genele (aproximativ 20.000-25.000) din genomul uman,
- A determina întreaga secvență (aproximativ 3 miliarde de perechi chimice de bază) care genomul uman de machiaj,
- A stoca această informație în baze de date,
- A îmbunătăți instrumente pentru analiza datelor,
- Pentru a transfera r- tehnologii avansate pentru sectorul privat și -
- Pentru a aborda aspectele etice, legale și sociale (ELSI) care pot apărea din proiect.
În plus față de genomul uman, genomul de șoarece și orez a fost, de asemenea, supus studiilor genomice.
Ce este proteomica?
Proteomica se referă la studiul întregului set de proteine produse de o celulă. Proteomul este setul complet de proteine produse de celulă. În proteomică, caracterizarea structurii 3D și a funcției proteinelor se realizează prin utilizarea unor metode de înaltă performanță. Tehnicile implicate în proteomică includ extracția și separarea electroforetică a proteinelor, digestia proteinelor cu utilizarea tripsinei în fragmente mici, determinarea secvenței de aminoacizi prin spectrometrie de masă și identificarea proteinelor folosind informațiile din bazele de date proteice. Mai mult, structura 3D a proteinei poate fi prezisă folosind metode bazate pe software. Expresia proteinelor poate fi studiată prin microarray-uri de proteine. Rețeaua hărților de rețea poate fi dezvoltată pentru a determina interacțiunile protein-proteine. Sunt prezentate diferite fenomene ale proteomicii figura 2.
Figura 2: Proteomică
Produsele proteice ale genelor genomului uman sunt studiate pe parcursul Proiectului Human Proteome (HPP). Unul dintre principalele obiective ale Proiectului Human Proteome este de a identifica proteinele implicate în bolile majore.
Asemănări între genomică și proteomică
- Genomica și proteomica sunt două domenii științifice strâns legate de studiul organismelor.
- Tehnicile de mare viteză sunt utilizate atât în genomică, cât și în proteomică.
Diferența dintre genomică și proteomică
Definiție
Genomics: Genomica se referă la studiul întregului set de gene într-un genom.
proteomica: Proteomica se referă la studiul întregului set de proteine produse de o celulă.
fenomene
Genomics: Genomica implică maparea, secvențierea și analiza genomului.
proteomica: Proteomica implică structura și funcția 3D a proteinelor și interacțiunile protein-proteine.
Clasificare
Genomics: Cele două tipuri de genomică sunt genomica structurală și genomică funcțională.
proteomica: Cele trei tipuri de proteomică sunt proteomica structurală, funcțională și de expresie.
Domenii importante
Genomics: Proiectele genomului de secvențiere, cum ar fi Proiectul genomului uman, sunt domeniile importante ale genomicii.
proteomica: Protocoalele de dezvoltare a bazei de date, cum ar fi SWISS-2DPAGE și dezvoltarea de software pentru proiectarea computerizată a medicamentelor sunt domeniile importante ale proteomicii.
Concluzie
Genomica și proteomica sunt două domenii științifice utilizate în studiul organismelor. Genomica este studiul întregului set de gene într-un organism, în timp ce proteomica este studiul întregului set de proteine produse de celulă. Principala diferență între genomică și proteomică este criteriul fiecărui domeniu în timpul studiului organismelor.
Referinţă:
1. Griffiths, Anthony JF. "Genomics: o prezentare generală". O introducere în analiza genetică. Ediția a șaptea, Biblioteca Națională de Medicină din S.U.A., 1 ianuarie 1970, disponibil aici.
2. Boundless. "Genomică și proteomică". Genomică și proteomică Boundless Biology, disponibil aici.
3. Graves, Paul R., și Timothy A. J. Haystead. "Ghidul biologilor moleculari pentru proteomică", Microbiologie și Biologie Moleculară, American Society of Microbiology, Mar. 2002, Disponibil aici.
Datorită fotografiei:
1. "Secvențierea broșurilor de mediu" de John C. Wooley, Adam Godzik, Iddo Friedberg - (CC BY 2.5) prin Wikimedia Commons
2. "Proteomics" De la Xxl7441 la Wikibooks, variante de scriere de limbă - Traducere din en.wikiscripts into Commons. (Domeniul Public) prin Wikimedia
