Differkinome

Diferența dintre proteomică și transcriptomică

Ştiinţă
Share

principala diferență între proteomică și transcriptomică este faptul că proteomica este studiul întregului set de proteine ​​produse de un anumit organism, în timp ce transcrip- tomica este studiul întregului set de mRNA sintetizat de un anumit organism.

Proteomica și transcriptomica sunt două domenii în care se studiază expresia genică a unui anumit organism.

Domenii cheie acoperite

1. Ce este proteomica?
     - Definiție, fapte, aplicații
2. Ce este Transcriptomics
     - Definiție, fapte, aplicații
3. Care sunt asemănările dintre proteomică și transcriptomică
     - Schița caracteristicilor comune
4. Care este diferența dintre proteomică și transcriptomică
     - Compararea diferențelor cheie

Termeni cheie

Aplicații, ARNm, Proteine, Proteomică, Tehnici, Transcriptomică

Ce este proteomica?

Proteomica este studiul pe scară largă a proteomilor. Proteomul se referă la întregul set de proteine ​​produse de un anumit organism sau de o celulă. Prin urmare, un anumit tip de organism sau celulă are un proteom unic. Principalele domenii de cercetare ale proteomicii sunt următoarele.

  • Predicția structurii 3D a unei proteine;
  • Detectarea locului și a timpului de sinteză a proteinei;
  • Ratele producției de proteine, degradarea și abundența în starea de echilibru;
  • Modificări ale proteinei, cum ar fi modificările post-translaționale;
  • Transportul proteinei între compartimentele subcelulare;
  • Implicarea proteinelor în căile metabolice;
  • Interacțiunea proteinelor una cu cealaltă.

    Figura 1: Exemple de structuri proteice disponibile din PPB

Mai multe tehnologii cu performanțe ridicate, cum ar fi spectroscopia de masă și diferența de electroforeză în gel (DIGE), sunt implicate în studiile de proteomie.

Ce este Transcriptomics

Transcriptomica este studiul transcriptomului unui anumit organism sau celular. Transcriptomul se referă la întregul set de ARNm în organism sau în celulă. Cu toate acestea, uneori se referă, de asemenea, la întregul set de ARN. Transcriptome variază în funcție de condițiile de mediu pe care organismul sau celulă trebuie să le facă față. Prin urmare, aceasta reflectă setul de ARN exprimat la un anumit timp, într-un anumit set de condiții. Transcriptomics include investigarea atât a profilului de expresie, cât și a analizei varietăților de felie. Microarramele ADN și Seq ARN sunt cele două tehnologii principale utilizate în transcripție.

Figura 2: Secvențe microarray și ARN

Asemănări între proteomică și transcriptomică

  • Proteomica și transcriptomica sunt două tipuri de domenii care studiază exprimarea genetică a unui anumit organism sau a unui tip de celule.
  • Tehnicile de înaltă performanță sunt utilizate atât în ​​proteomică, cât și în transcriptomică.

Diferența dintre proteomică și transcriptomică

Definiție

Proteomica se referă la studiul proteomilor și al funcțiilor lor, în timp ce transcripția se referă la studiul transcriptomilor și al funcțiilor lor.

Tip de studiu

Proteomica studiază întregul set de proteine ​​exprimate în timp ce transcripția studiază întregul set de ARNm exprimat într-un anumit organism.

fenomene

Proteomica studiază structura și funcția 3D a proteinelor și interacțiunile protein-proteine ​​în timp ce transcripția studiază structura secvenței, interacțiunile cu mediul și aplicațiile ARNm.

Tehnici

Proteomica implică spectroscopie de masă și electroforeză diferențială în gel (DIGE), în timp ce transcripția implică microarray ADN și ARN Seq ca tehnici.

Domenii importante

Unele dintre domeniile importante ale proteomicii sunt dezvoltarea de baze de date proteome, cum ar fi SWISS-2DPAGE și dezvoltarea de software pentru proiectarea computerizată a medicamentului, în timp ce transcrip- tomica implică studiul diferențierii celulare, carcinogenezei, mecanismelor moleculare și căilor de semnalizare, care controlează dezvoltarea embrionară timpurie biomarkeri pentru evaluarea riscului de droguri sau substanțe chimice și deducerea relațiilor filogenetice între indivizi.

Concluzie

Proteomica este studiul întregului set de proteine ​​dintr-un anumit organism, în timp ce transcripția este studiul întregului set de ARNm al organismului. Prin urmare, principala diferență dintre proteomică și transcriptomică este tipul de studiu.

Referinţă:

1. "Ce este proteomica?" Proteomica: o introducere în resursele EMBL-EBI, 8 iunie 2016, disponibil aici
2. Lowe, Rohan și colab. "Tehnologii de transcripție". PLoS Computational Biology 13.5 (2017): e1005457. PMC. Web. 10 iulie 2018, disponibil aici

Datorită fotografiei:

1. "Exemple de structură a proteinelor" De Axel Griewel - Activitate proprie (CC BY-SA 3.0) prin Wikimedia Commons
2. "Microarray și celula de flux secvențială" de Thomas Shafee - Muncă proprie (CC BY 4.0) prin Wikimedia Commimedia

Ştiinţă
×